肿瘤相关基因组检测公共数据库介绍MSK

之前在一篇NC的文献(如何利用公共数据发NC)当中，提到过一个公开的测序数据(MSK-IMPACT)。所以今天就来简单的介绍一下这个数据集。这样，在进行公共数据挖掘的时候，除了TCGA。同时也可以考虑用有这个数据集来增加分析的内容

通过二代测序的高通量检测方法，我们可以一次性检测一个人很多基因的基因组的变化。MSK-IMPACTTM是一种基于NGSpanel的杂交捕获技术，可快速检测与癌症相关的个基因上的所有蛋白质编码突变、拷贝数变异、启动子突变以及结构重排的信息。不同于常规检测，MSK-IMPACTTM适用于任何肿瘤类型。

如果只是说，这个测序技术可以来对患者进行基因组信息检测的话，其实对于我们科研而言也没有什么用。关键的是，纪念斯隆·凯特琳癌症研究中心（MemorialSloanKetteringCancerCenter，简称MSK）把他们之前对于患者检测的多个样本都共享出来了，供研究者进行数据挖掘。这样就方便我们使用了。这个数据都保存在cBioPortal网站上(