肿瘤解决方案重磅出击
肿瘤!威胁现代人类健康的重大疾病,是一种多发性、多因素诱发的复杂疾病[1]。
伴随着科技的发展,对肿瘤发生与发展的复杂机制研究有了重大突破,然而仅从单一的mRNA水平或miRNA水平不足以阐述肿瘤启动与维持的分子机理,而多组学方法的应用,可以整合多种信息,对高通量测序产生的海量数据进行降维、归一化、关联性分析[2,3]和可视化处理,实现更精确的肿瘤分型和分期[4,5],准确筛选肿瘤相关biomarkers和潜在的药物靶标。
诺禾致源基于mRNA测序、非编码RNA测序、表观组测序等多种NGS方法,开发出适用于肿瘤研究的多组学研究策略。系统、全面地构建调控网络,助力发掘特定肿瘤细胞驱动基因、筛选肿瘤发生biomarkers,实现肿瘤早期诊断;筛选不同亚型肿瘤的关键通路或关键基因,作为药物靶标,实现靶向治疗,助力为肿瘤患者提供定制化诊疗方案,实现精准医疗。
技术路线分析内容包括lncRNA测序(含mRNA分析)、全基因组甲基化测序的全套标准分析和高级分析,以及RNA测序与甲基化测序的全方位关联分析。从转录本结构水平和表达水平、基因甲基化水平分析肿瘤驱动基因。
部分结果展示潜在肿瘤驱动基因肿瘤相关SNP分析
潜在肿瘤驱动基因筛选
潜在肿瘤驱动基因启动子甲基化水平分析
肿瘤驱动基因功能分析(GO互作分析)
主成分分析(PCA)
KEGG功能富集分析
肿瘤相关转录本调控网络
随着二代测序技术日益发展成熟,基因组学、转录组学、表观遗传学等研究方法在医学领域的应用逐渐完善。
利用转录组学,可以在RNA水平分析结构变异(SNP/InDel、AS),更能够分析表达水平的差异,以挖掘biomarker。通过表观遗传学(以甲基化研究为主)可以在全基因组范围内分析胞嘧啶甲基化水平,并重点研究与基因表达密切相关的启动子区域或CpG岛。
通过多组学的分析,在肿瘤诊断方面,助力挖掘肿瘤发生的biomarker,研究肿瘤发展的分子机理;在肿瘤治疗方面,去甲基化药物的开发与应用,已成功应用于临床,助推精准医疗。
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